Компания (ДУЛ нет), ввозит партию продукции, оформляет ДС ПП 353. Эту партию приобретает вторая компания (есть ДУЛ с изготовителем). Вторая компания может оформить серийный СС на эту продукцию, отобрав образцы из партии, ввезенной другим импортером?

Да, но заявитель должен подтвердить. В качестве рекомендации можно поменять заявителя в упрощенной ДС. Вы можете оформлять упрощенные ДС на того заявителя, с которым у вас есть ДУЛ, при этом нет требования о том, что именно импортер должен оформлять упрощенную ДС.